Entre las principales atribuciones que el Estatuto de la Universidad le otorga a la Junta Directiva, se encuentran:

• Designar a los funcionarios superiores de la Universidad
• La aprobación de grados académicos, diplomas y certificados que la Universidad Arturo Prat puede otorgar.
• La aprobación del Presupuesto Anual de la Universidad
• La aprobación de la Cuenta Anual del Rector