La Secretaria General es un organismo Superior de la Universidad que da fe de los actos de la Corporación, prepara, certifica y transcribe los instrumentos Normativos y los Documentos Oficiales de la Universidad, lleva el Archivo Central, custodia el Sello de la Corporación, es responsable de la emisión de los Certificados y diplomas de Titulo y/o Grado que otorga la Universidad, comunica a los funcionarios los actos y decisiones de los Organismos Superiores que los afecte, presta asesoría en materias legales, estatutarias y reglamentarias, y es responsable del flujo y registro de documentos y correspondencia de la Universidad. En general, cumple también con las labores de coordinación intra-institucionales que expresamente le encomiende o delegue la Rectoría.
La Secretaria General, depende jerárquicamente de Rectoría y está estructurada de la siguiente forma: